Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam208bQ5DTT3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam208bQ5DTT3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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