Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy3Q5DTK1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chsy3Q5DTK1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms