Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp13Q5BKP2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms