Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms