Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shank3Q4ACU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shank3Q4ACU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shank3Q4ACU6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms