Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxn3Q499D0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms