Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apobec4Q497M3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec4Q497M3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec4Q497M3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms