Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt35Q497I4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt35Q497I4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt35Q497I4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms