Protein–RNA interactions for Protein: Q3V172

Sel1l2, Protein sel-1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l2Q3V172 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sel1l2Q3V172 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sel1l2Q3V172 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sel1l2Q3V172 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms