Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ulk4Q3V129 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ulk4Q3V129 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk4Q3V129 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms