Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc185Q3V118 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc185Q3V118 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms