Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc27Q3V036 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc27Q3V036 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms