Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SvipQ3UZP4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SvipQ3UZP4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvipQ3UZP4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvipQ3UZP4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvipQ3UZP4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvipQ3UZP4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvipQ3UZP4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SvipQ3UZP4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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