Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnpc3Q3UZ01 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms