Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc55Q3UY51 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc55Q3UY51 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms