Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap1Q3UUV5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms