Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trat1Q3UU67 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms