Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B230104I21RikQ3USW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.33■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms