Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhdc9Q3USL1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms