Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc190Q3URK1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc190Q3URK1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc190Q3URK1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc190Q3URK1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc190Q3URK1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms