Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms