Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nhlrc4Q3UP44 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlrc4Q3UP44 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms