Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skap2Q3UND0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skap2Q3UND0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms