Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cln5Q3UMW8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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