Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrch2Q3UMG5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrch2Q3UMG5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrch2Q3UMG5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms