Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam83fQ3UKU4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam83fQ3UKU4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam83fQ3UKU4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam83fQ3UKU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam83fQ3UKU4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam83fQ3UKU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam83fQ3UKU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam83fQ3UKU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms