Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UJC8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UJC8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UJC8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3UJC8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q3UJC8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q3UJC8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q3UJC8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UJC8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UJC8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q3UJC8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Q3UJC8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UJC8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UJC8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UJC8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UJC8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UJC8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UJC8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms