Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Edc4Q3UJB9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Edc4Q3UJB9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms