Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnep1r1Q3UJ81 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnep1r1Q3UJ81 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms