Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd8Q3UFK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd8Q3UFK8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms