Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms