Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnft2Q3UF64 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnft2Q3UF64 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms