Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pid1Q3UBG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pid1Q3UBG2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms