Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cops9Q3U898 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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