Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl21Q3U410 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl21Q3U410 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klhl21Q3U410 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms