Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Rnf40Q3U319 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf40Q3U319 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Rnf40Q3U319 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Rnf40Q3U319 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Rnf40Q3U319 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Rnf40Q3U319 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf40Q3U319 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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