Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc174Q3U155 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc174Q3U155 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms