Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KhsrpQ3U0V1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KhsrpQ3U0V1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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