Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88bQ3TYP4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88bQ3TYP4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms