Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3TTL0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTL0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3TTL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTL0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTL0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTL0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTL0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms