Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D17Wsu92eQ3TT38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms