Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pnpla6Q3TRM4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnpla6Q3TRM4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnpla6Q3TRM4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms