Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc102aQ3TMW1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms