Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc10Q3TLI0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trappc10Q3TLI0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms