Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2afvQ3THW5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2afvQ3THW5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms