Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2bQ3TD49 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sppl2bQ3TD49 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms