Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem104Q3TB48 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem104Q3TB48 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms