Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd8Q3TA59 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd8Q3TA59 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms