Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms