Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP4

Gm17416, Beta-defensin (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17416Q30KP4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17416Q30KP4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm17416Q30KP4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17416Q30KP4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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