Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KncnQ307W7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KncnQ307W7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms